企業管理采用戰略成本管理可以將企業的市場競爭優勢提升，為企業的生存發展進行全面的分析考慮，實現企業的長遠經濟目標。但是，當前企業進行戰略成本管理，還是存在著一定的問題，這些問題的出現不僅對企業的管理和發展產生影響，也影響著企業競爭力的提升。
1、財務管理前瞻性不夠
戰略成本管理在企業管理中的應用，并不是完美的。當前在企業戰略成本管理中還存在著一些問題，其中在企業財務管理的前瞻性上就表現出一定的不足。戰略成本管理在財務管理上還停留在利潤最大化的傳統成本管理理念上，對財務的管理沒有從長遠的角度考慮，沒有一個長遠的規劃計劃，進而導致企業發展中成本管理沒有一個合理的戰略目標。同時，因為戰略成本管理對財務管理的前瞻性不夠，導致企業的項目投資存在一定的盲目性，進而造成企業資源調動上出現混亂。
2、財務制度執行力度不足
企業的財務制度為戰略成本管理的運行起到了一個良好的保障作用，但是在實際運行中，很多企業并沒有嚴格地按照財務制度進行各項經濟活動，在企業戰略成本管理中，企業內部沒有一個良好的運行機制，使得企業成本管理中出現一些違規操作的行為，影響了企業的發展。企業的財務人員在財務管理中并沒有對企業的戰略成本管理作出一個正確合理的分析，進而在企業生產經營中出現資金浪費，影響企業的健康發展。
3、沒有科學的核算程序
戰略成本管理在企業管理中具有非常重要的作用，是企業提升市場競爭優勢，實現發展目標和經濟效益的手段之一。但是，當前很多企業的戰略成本管理缺乏一個合理的核算程序，在企業成本管理中因為沒有一個科學的核算程序，進而造成資金的流動、管理沒有得到真正落實，一些企業人員為了自身的利益進行資金的挪用等，出現違紀違法的現象，給企業管理帶來了嚴重的影響，同時也影響著企業戰略成本管理。
4、缺少成本管理人才
目前市場經濟尚未完全發展成熟，不少企業的獨立性和自主性不足，戰略成本管理只在少數大中型企業中有所應用，多數的中小企業并未推行戰略成本管理。從事戰略成本管理的專業人才極為缺乏，多數承擔研究戰略規劃工作的人員為企業技術人員，該類工作人員雖熟知本企業技術工藝，但對成本管理涉獵不深，不具備戰略規劃能力，在推行戰略成本管理時，往往直接套用其他企業經驗，忽略了本企業自身的發展特點，在一定程度上影響到企業決策的前瞻性，不利于企業戰略成本管理的實施。
